弗利多的正体便是死去的守护忍十二士的政变主谋者卡兹玛。阿斯玛越过了十年，再次的同弗利多对决起来。另一方面，打算阻止开始失控的空的木叶村的伙伴们因战斗而疲劳之极，也迎来了查克拉的极限，就在那样之中，空与鸣人间的查克拉产生起了共鸣现象…

　　就在大江户也卷入到了龙宫的乙姬可怕计划时，终于也进入到了最终的阶段。为了阻止她的野心，银时，桂，新八，神乐奔走着…他们的战斗的结果？地球的命运将会？

　　小智等人决定参加在天冠山山脚下开学的神奇宝贝暑期学校。暑期学校是将训练家们集合起来，一起度过一周的时间来学习神奇宝贝知识的特别课程。小智等人第一项挑战的课程就是要选中任意一颗神奇宝贝球，培育其中的神奇宝贝并进行对战。

　　母亲节的礼物中，有一份是古雷塔画的兹利的画。有利还发觉了一幅没画出脸部的画。那便是古雷塔的母亲的画。古雷塔一直记不起从儿时就分开了的母亲的脸，就在那时古雷塔的故乡佐拉希亚的重臣玛利提兹造访了血盟城，他此行的目的是希望能带古雷塔回去佐拉希亚。就在即将高兴返回故乡和但又即将与有利分别的复杂心情中古雷亚难以下定决心的晚上，血盟城出现了幽灵。

　   特雷兹操作下，飞行艇平安的在湖面着落了，然而特雷兹却遇上了新的麻危机。在同孩子们分手之后，返回了宾馆。当晚特拉维斯造访了特雷兹，并向他说出了事件的幕后主谋，与此同时，特雷兹和莉莉亚二人的暑假旅行也打算结束了…

　　边界遭受着帕迪拉的攻击之下出现了物资不足。能源被限制提供，就连食品和水也全部进行着限制配给。同时雪莉仍旧没恢复健康，也变得越发不安起来，打算去找亚尔特然而却因高烧而倒下了…

　   早晨，沙英在桌旁醒了过来。广起来后不知为何一阵惊慌的样子，打听一番后得知因为下午就与杂志的编辑一起商讨着下回小说的标题的事而彻夜未眠，这让沙英担心起广来，之后，同编辑约在了咖啡店相见…

　　着迷于电视节目中看到的温泉的拉拉，打算自己挖出个泉源来，并制造了一台挖地机。听闻此事的春菜，里纱，未央，猿山等也为此而来，就在挖堀过程中竟挖到了德川宝藏，然而拉拉的目标只有温泉，不久之后一行人来到了一处宽大的地下洞窟…

　　芳佳们在执行完伦敦特别任务的返程途中遭遇了涅罗伊的袭击，然而却被夜间的侦察中的萨亚相助。目击者的芳佳被命令一同参加夜间行动…